Лечение гастрита у детей обычно заключается в устранении причины, что можно сделать путем подавления секреции желудочной кислоты с помощью ингибиторов протонной помпы или ингибиторов H2-рецепторов, а также путем приема лекарств для защиты слизистой оболочки желудка. Детей с рефлюксом можно лечить такими препаратами, как морфолин, но лечение против H. pylori не рекомендуется.