Если цель анализа крови — определить, какой агент ответственен за HFMD, то показаны антитела к коксакивирусу группы А типа 16 или энтеровирусу 71. Однако существуют и другие патогены, вызывающие HFMD, которые невозможно полностью идентифицировать с помощью анализа крови, и эти вирусы, скорее всего, вызывают коварные инфекции, т.е. без клинических симптомов или просто герпесную ангину. Поэтому невозможно определить, болен ли человек HFMD, путем поиска антител к этому возбудителю, так как для описания HFMD необходимо наличие клинических признаков. Если целью теста является определение тяжести HFMD, можно посмотреть на уровень лейкоцитов, который, скорее всего, будет высоким, если он превышает 15 в 10^9 единиц. Если С-реактивный белок также повышен, это может быть подтверждено со стороны, а функция печени, сердечные ферменты и функция почек используются для определения наличия повреждений печени, почек или сердечной мышцы, вызванных HFMD.