Легочные заболевания, вызванные бактериальными инфекциями, которые лечатся неэффективно или с помощью неподходящих лекарств, могут привести к изменениям в состоянии пациента и даже к обострению, которое часто визуально проявляется усилением респираторных симптомов. Например, у пациента может наблюдаться усиленный кашель, увеличение количества мокроты, а в некоторых случаях — повышение температуры и даже затруднение дыхания. Поэтому важно проверить наличие патогенных бактерий у этой группы пациентов. Обычно мокрота может быть взята для общего бактериального мазка и культуры до того, как будет назначена эффективная антиинфекция. Перед этим антибиотики должны назначаться эмпирически в соответствии с показателями пациента, а затем корректироваться в соответствии с результатами определения чувствительности к препаратам, чтобы избежать обострения состояния пациента.