Клиническая картина центральной инфекции, вызванной энтеровирусом 71, вариабельна, а тяжесть заболевания различна. Основными проявлениями центральной инфекции EV71 являются асептический менингит, энцефалит ствола мозга, микроцефалит, полиомиелитоподобный синдром и энцефаломиелит, большинство из которых возникает у маленьких детей в возрасте до 5 лет, с наибольшей частотой у младенцев в возрасте до 1 года. Основной причиной смерти является сердечно-легочная недостаточность, вторичная по отношению к энцефалиту ствола мозга, с поражением или без поражения кожи рук, ног, ягодиц и слизистой оболочки полости рта. Основными проявлениями энцефалита ствола мозга являются функциональные нарушения дорсального ствола мозга и прилегающих к нему нервных тканей, таких как позвоночный пучок и мозжечок, которые могут включать аномальные движения глаз, такие как нистагм, зрачковые аномалии, миоклонус (в основном в проксимальных конечностях), неустойчивость походки и тремор, атаксию, аномалии черепных нервов (особенно 6-й и 7-й пар черепных нервов), раздражение менингеальной оболочки, тахикардию, аномальные движения кишечника, рвоту. гипертония, дисфагия и измененное сознание. Рвота, тахикардия, гипертония и дисфагия являются важными признаками нарушения функции ствола мозга. Энцефалит ствола мозга классифицируется на три класса в зависимости от степени неврологического поражения: класс I проявляется тремором миокарда и атаксией, оставляя необратимые неврологические последствия у 5% детей; класс II проявляется тремором миокарда и поражением черепных нервов, оставляя последствия у 20% детей; класс III проявляется быстрой сердечно-легочной недостаточностью, приводящей к смерти у 80% детей, с тяжелыми последствиями у всех выживших. Эти критерии классификации определяют клинический диагноз. Молодой возраст (17 x 109/л) является основным фактором плохого прогноза при инфекции EV71 с поражением ЦНС. Потенциальные факторы риска поражения ЦНС включают гипертермию с температурой выше 39°C в течение более 3 дней, головную боль, рвоту, летаргию, судороги и гипергликемию, причем гипертермия, длящаяся более 3 дней, является наиболее важной.