Омепразол может использоваться для лечения рефлюкс-эзофагита с такими побочными эффектами, как головная боль и диарея, и для облегчения изжоги. Если изжога возникает после прекращения приема препарата, необходимо повторное посещение врача для выявления причины, и можно рассмотреть возможность смены препарата или приема других лекарств, а если изжога сохраняется, можно рассмотреть возможность проведения таких процедур, как антирефлюксная хирургия.