Существует множество причин нейтропении, но наиболее распространенными являются лекарства, радиация и аутоиммунные факторы.
Количество нейтрофилов обычно может быть восстановлено после устранения причины и лечения симптомов. Однако при тяжелой нейтропении организм не в состоянии выработать эффективную воспалительную реакцию для борьбы с инфекцией, и уровень смертности высок.