Синдром Кальмана генетически гетерогенен, четкий генетический диагноз доступен примерно для 1/3 — 1/2 пациентов, а у некоторых пациентов имеются двойные или множественные мутации. В практической деятельности очень сложно оценить вес каждой генетической мутации в развитии заболевания, поэтому очень сложно оценить риск развития заболевания в следующем поколении у пациентов с успешным лечением бесплодия; Конечно, для пациентов с четким диагнозом причинного гена моногенные пациенты с четким диагнозом причинного гена могут быть рассмотрены для технологии ЭКО третьего поколения — преимплантационного генетического тестирования эмбрионов для скрининга здоровых эмбрионов для переноса, чтобы избежать наследования дефектного гена, в то время как для пациентов с неясным диагнозом причинного гена или несколькими причинными генами эффективный скрининг не может быть сделан.