Бородавки склонны к рецидивам, и повторные атаки могут повлиять на психическое здоровье и качество жизни человека. Вирус папилломы человека тесно связан с некоторыми злокачественными опухолями, и региональные бородавки на вульве, влагалище, половом члене или перианальной области могут трансформироваться в сквамозную карциному, трансформация которой обычно занимает 5-40 лет. Процесс может заключаться в том, что вирус вызывает доброкачественную гиперплазию, которая прогрессирует через различные стадии атипичной интерстициальной трансформации вогнутых клеток до неясной карциномы in situ и, наконец, злокачественной опухоли. В частности, существует четкая корреляция между инфицированием женщин вирусом папилломы человека высокого риска и заболеваемостью раком шейки матки. Поэтому бородавки следует регулярно лечить в период их появления с помощью комбинации иммуномодулирующих препаратов, антивирусных средств или лазера, криотерапии или фотодинамической терапии Ира, чтобы удалить бородавку и предотвратить рецидив.