Преобладают вирусы, наиболее распространенным из которых является респираторно-синцитиальный вирус (РСВ), а другие вирусы включают вирус парагриппа, аденовирус, энтеровирус и парапневмовирус человека. Помимо вирусов, инфекции Mycoplasma pneumoniae и Chlamydia pneumoniae также могут вызывать капиллярный бронхиолит.