СПИД характеризуется репликацией вируса в организме после заражения СПИДом. По мере размножения вирус продолжает атаковать иммунную систему организма, главным образом CD4+ T-лимфоциты, вызывая тем самым постоянное снижение количества CD4+ T-лимфоцитов. После того как количество CD4+ Т-лимфоцитов снизится до определенного уровня, у пациента разовьется оппортунистическая инфекция, обычно <200/мм^3, и пациент будет склонен к стадии СПИДа. На стадии СПИДа у пациентов могут развиться различные оппортунистические инфекции в различных системах из-за разрушения иммунной системы, такие как пневмоцистная пневмония, криптококковый менингит, а также злокачественная лимфома, саркома Капоши и др. Если не лечиться, пациенты в конечном итоге умирают от оппортунистических инфекций, а также от злокачественных опухолей.