Средний инкубационный период у людей с ВИЧ без лечения составляет около 9 лет. Во время инкубационного периода у пациента нет явных симптомов, но вирус уже реплицируется в организме пациента во время инкубационного периода. Поскольку вирус продолжает размножаться, а иммунная система ослаблена, количество CD4+ Т-лимфоцитов у пациента продолжает снижаться. После перехода в стадию СПИДа у пациента развиваются различные оппортунистические инфекции, вызванные крайне низкой иммунной функцией. Это может проявляться в виде лихорадки, ночной потливости, диареи, потери веса на 10% и более в течение более одного месяца, а у некоторых пациентов могут также развиться нейропсихиатрические симптомы, такие как потеря памяти и психическая апатия. Кроме того, могут возникнуть генерализованное увеличение лимфатических узлов, пневмоцистная пневмония, криптококковый менингит, эзофагит Candida albicans, гигантоклеточный ретинит и т.д., и в конечном итоге смерть может наступить от оппортунистических инфекций. Средний период выживания на стадии СПИДа составляет около 12-18 месяцев.