Гематурия, вызванная урологическими заболеваниями, может быть разделена на две категории: медицинская гематурия, которая в основном вызвана различными видами гломерулонефрита; и хирургическая гематурия, которая вызвана урологическими опухолями, камнями, туберкулезом, пороками развития, травмами и другими заболеваниями. Врач проведет предварительное различие между двумя видами гематурии (первичный скрининг), а затем направит пациента в медицинское или урологическое отделение для детального обследования. Хирургическая гематурия вызывается разрывом кровеносного сосуда в месте повреждения и часто сопровождается появлением крови и кровяных сгустков. Гематурия не сопровождается кровью и сгустками крови, а поскольку базовая мембрана трудно поддается восстановлению, вряд ли она быстро исчезнет. Фазово-контрастная микроскопия помогает отличить одно от другого, а морфология эритроцитов мочи различается между медицинской и хирургической гематурией. Деформированная эритроцитарная гематурия свидетельствует о медицинской гематурии, а гомогенная эритроцитарная гематурия — о хирургической гематурии.