Существует три периода после заражения, а именно: острая фаза, бессимптомная фаза и фаза СПИДа. Острая фаза наступает примерно через 2-4 недели после первоначального заражения. Некоторые инфицированные пациенты могут испытывать лихорадку, общее недомогание, головную боль, тошноту, рвоту, диарею, боль в суставах, опухшие лимфатические узлы и т.д., но не частое или срочное мочеиспускание. В бессимптомной фазе часто у пациентов нет явных симптомов, и она может длиться около 6-8 лет. В конце концов пациент переходит в стадию СПИДа, при которой основными проявлениями являются лихорадка, ночная потливость, диарея, длящаяся более одного месяца, сопровождающаяся потерей веса более чем на 10%, и может сопровождаться различными инфекциями, только при воспалении мочевыводящих путей может появиться учащенное и срочное мочеиспускание.