Наиболее распространенным патологическим фактором, приводящим к появлению запаха из пупка, в основном является умбилицит, за которым следуют экзема или потница пупочной ямки, врожденные заболевания пупочного канала, такие как незакрытый пупок, кисты, свищи и т.д. Аллергия, повреждения кожи, воспаления и выделения могут также привести к появлению запаха из-за физических различий или неправильного использования пластырей для пупка.