Герпесный фарингит и HFMD имеют часть одного и того же возбудителя, схожие эпидемические сезоны и клинические симптомы, поэтому их часто легко спутать друг с другом.
Согласно «Руководству по лечению заболеваний рук, ног и рта» издания 2018 года.
В эпидемический сезон HFMD, когда сыпь на руках, ногах и ягодицах еще не появилась на ранних стадиях герпесного фарингита у детей, необходимо уделить внимание общению с родителями и наблюдению за сыпью на руках, ногах и ягодицах; если сыпь на руках, ногах и ягодицах так и не появилась, ее можно рассматривать как герпесный фарингит и диагноз HFMD не подходит; и
если обнаружен типичный герпес на руках, ногах и ягодицах, его следует лечить по схеме HFMD.
В тяжелых случаях с атипичной сыпью диагноз должен быть поставлен в сочетании с патогенезом или сывороточными антителами.