Побочным эффектом является повреждение слизистой оболочки носа. Повреждения, вызванные назальной эндоскопией, носят в основном механический характер. У некоторых пациентов носовая полость очень узкая или анатомические аномалии носовой полости более выражены, и слизистая оболочка носа может быть стерта во время осмотра, что вызывает такие симптомы, как воспаление и боль в слизистой оболочке носа.