Основными клиническими проявлениями синдрома антифосфолипидных антител являются тромбозы, привычный выкидыш и тромбоцитопения, причем у одного и того же пациента может быть только одно из этих проявлений или несколько проявлений одновременно. Клиническая картина зависит от типа, расположения и размера вовлеченных сосудов и может проявляться в виде скопления одного или нескольких сосудов. Венозный тромбоз встречается чаще, чем артериальный, причем венозный тромбоз наиболее распространен в глубоких венах нижних конечностей, а также в почках, печени и сетчатке глаза, а артериальный тромбоз чаще встречается в головном мозге и верхних конечностях. Ретикулярный цианоз также является наиболее распространенным проявлением синдрома антифосфолипидных антител и проявляется в виде ретикулярного цианоза рук и ног примерно у 80% пациентов.