Дифференциация недифференцированного заболевания соединительной ткани обычно определяется как эволюция в конкретное заболевание соединительной ткани, а то, сколько времени потребуется для дифференциации, связано с такими факторами, как состояние пациента и эффективность лечения. Из них около 70% пациентов останутся недифференцированными и около 30% эволюционируют в заболевание соединительной ткани (ЗСТ), причем частота эволюции выше через три-пять лет после начала заболевания. По мере прогрессирования заболевания частота эволюции снова снижается, и основными КТД, которые могут эволюционировать, являются системная красная волчанка, системный склероз и ревматоидный артрит.