У пациентов с легочным шистосомозом рекомендуется лечить патогенез с помощью лекарств, как только диагноз будет ясен. Основная причина отказа от хирургического лечения заключается в том, что у пациентов с легочным шистосомозом имеются рассеянные поражения легких, которые не поддаются хирургическому лечению, и поэтому в настоящее время их лечат в основном лекарственными препаратами. Препаратом выбора является празиквантел, который используется потому, что его побочные эффекты мягкие и могут переноситься большинством людей. С другой стороны, курс лечения этим препаратом относительно короткий, всего 3 дня, и большинство пациентов способны придерживаться приема препарата, а комплаентность пациентов лучше. Более того, после применения этого препарата пациенты могут получить хорошие результаты клинического наблюдения, которые показывают, что кровянистая мокрота исчезает, яйца в мокроте становятся отрицательными, а легочные поражения хорошо рассасываются. Если у пациента имеется плевральный выпот, то после лечения празиквантелом плевральный выпот также может значительно уменьшиться или даже исчезнуть. Помимо празиквантела, пациенты также могут использовать альбендазол для лечения патогенных микроорганизмов, но длительность его применения больше, чем празиквантела, и требует 7 дней непрерывного приема.