В научном сообществе нет единого мнения о причине трещин на языке. Она может быть связана с возрастом, так как старение организма приводит к снижению способности языка поглощать питательные вещества, что приводит к нарушению обмена веществ и появлению трещин.
Некоторые системные заболевания часто связаны с расщелиной языка, включая врожденную дисплазию, синдром Дауна, дефицит питательных веществ, например, дефицит витамина B2 (рибофлавина), инфекционные причины, например, сифилитическая инфекция языка, и некоторые редкие заболевания, такие как синдром Мелькерссона-Розенталя (синдром Май-Ро).
Это заболевание также связано с генетическими факторами, и встречаются семейные линии с высоким уровнем заболеваемости.