Внутричерепные множественные очаги кальцификации, как и очаги кальцификации костей или легких, вызваны старыми повреждениями или физиологической кальцификацией, например, шишковидной железы и базальных ганглиев хороидного сплетения, которые образуют некоторые точки кальцификации в процессе роста и развития. Однако эти кальцифицированные пятна обычно не вызывают у пациентов никаких симптомов, и пациентам не нужно слишком беспокоиться. Однако некоторые из множественных кальцификатов в мозге вызваны такими заболеваниями, как наследственные заболевания, опухолевые заболевания, врожденные генетические заболевания обмена веществ, гипопаратиреоз, токсичность витамина D и др. Рекомендуется искать эти причины.