Chlamydia trachomatis является распространенным возбудителем неонатального конъюнктивита. При неонатальном конъюнктивите Chlamydia trachomatis является ведущим возбудителем, составляя 10%-74% случаев, что намного выше, чем гонококки, и может также привести к трахоме. Chlamydia trachomatis — грамотрицательная бактерия, не имеющая ферментной системы для синтеза высокоэнергетических веществ (например, АТФ) и являющаяся прокариотическим внутриэпителиальным паразитом. Chlamydia trachomatis — самый близкий к человеку возбудитель рода Chlamydia, способный инвазировать эпителий мочевыводящих и половых путей. Существует 15 подтипов Chlamydia trachomatis, из которых подтипы D-K вызывают инфекции половых путей и глаз, а 10 серотипов, включая D-K, Da и Ia, вызывают конъюнктивит у новорожденных. Chlamydia trachomatis широко распространена в воздухе, коже и выделениях пациентов и передается различными путями. В частности, у людей с трахомой часто бывают красные глаза и слизистые выделения, иногда с насморком, и патогенные микроорганизмы трахомы, содержащиеся в выделениях, легко распространяются на пальцы, одежду, полотенца, посуду для мытья или другие предметы, с которыми они контактируют, а когда люди находятся в тесном контакте, Chlamydia trachomatis легко передается при перекрестном контакте. Это может привести к повторным инфекциям, что может увеличить тяжесть воспаления трахомы.