Существует множество причин повторных самопроизвольных абортов, при этом анатомические аномалии составляют 10%, в основном любой препарат, влияющий на кровоток в матке и эндометрии, вызывает выкидыш. Врожденные пороки развития матки являются распространенной причиной раннего выкидыша. Аномалии матки включают продольную матку, однорогую матку и двурогую матку, в результате чего полость матки становится маленькой и не может расшириться для развития и изгнания эмбриона, а плохое кровоснабжение продольной матки делает ее непригодной для развития эмбриона. Аномальное врожденное развитие шейки матки или травма в результате аборта на ранних сроках беременности, в результате чего шейка матки открывается неплотно, не выдерживает внутриутробного давления увеличенного плода и приводит к выкидышу. В последние годы заметно увеличилось количество внутриматочных операций, что приводит к травматическому образованию маточных спаек, которые деформируют полость матки, а в тяжелых случаях влияют на формирование ложа и плаценты, приводя к раннему выкидышу. Частота фибромиомы высока у женщин, и когда подслизистые фибромиомы большие, они блокируют полость матки и влияют на имплантацию, что приводит к выкидышу. Деформации матки можно лечить с помощью пластической хирургии, фибромиомы — с помощью миомэктомии или ультразвукового фокусированного ножа, гистероскопического разделения спаек матки и перевязки эндоцервикса на 16-20 неделе беременности в случаях вялого раскрытия эндоцервикса.