CA125 также известен как гликановый антиген 125, и нормальный уровень CA125 недостаточен для того, чтобы полностью исключить эндометриоз. CA125 относится к разновидности опухолевых маркеров, у пациенток с эпителиальным раком яичников, раком маточной трубы, раком эндометрия, аденокарциномой легкого, аденокарциномой желудочно-кишечного тракта и другими заболеваниями после обследования можно увидеть повышение этого показателя. У большинства пациенток с эндометриозом повышен СА125 и другие опухолевые маркеры, однако не у всех пациенток с эндометриозом повышен СА125, у некоторых он нормальный, а эндометриотические клетки эндометриоза не всегда выделяют СА125. Повышенный СА125 обладает низкой чувствительностью и специфичностью для диагностики эндометриоза и не может использоваться в качестве независимого диагностического критерия, а нормальный СА125 не может полностью исключить эндометриоз.