При идиопатической интерстициальной пневмонии рекомендуется хирургическая биопсия легкого или торакоскопическая биопсия легкого, причем по возможности следует проводить несколько биопсий, чтобы гетерогенность заболевания не привела к необъективной диагностике. Из-за высокой стоимости и вреда вышеуказанных биопсий население страны менее охотно идет на их проведение, поэтому в большинстве больниц вместо хирургических или торакоскопических процедур проводятся бронхоскопия и чрескожная биопсия легких под контролем КТ. По сути, ценность этих исследований заключается не в их диагностической значимости, а в исключении других заболеваний. Следует отметить, что для некоторых типичных типов идиопатической интерстициальной пневмонии, таких как IPF, опытный пульмонолог может поставить более точный диагноз на основании клинических и визуализирующих исследований, и диагностическая ценность клинических и визуализирующих исследований подтверждена в руководстве по IPF.