Подъязычные железы расположены под слизистой оболочкой на дне полости рта, по одной с каждой стороны, и выделяют слизь, которая по протокам попадает в полость рта. Подъязычные кисты можно классифицировать как экстравазированные или ретенционные. Экстравазированные кисты могут быть вызваны разрывом протоков и утечкой слизи в тканевые пространства. Ретенционные кисты в основном вызваны частичной непроходимостью протоков, приводящей к плохому оттоку слизи, что может быть вызвано мелкими камнями, искривлением протоков и т.д. Мелкие остатки пищи могут попасть в протоки и в результате образовать камни. Обычно следует есть меньше пищи, которая легко образует во рту порошкообразные вещества, например, печенье и сбитые семена дыни.