В подавляющем большинстве случаев уретральные карункулы вряд ли исчезнут сами по себе. Это связано с тем, что карункул представляет собой значительную ткань, а когда эти ткани разрастаются, они становятся все более крупными и вряд ли уменьшатся сами по себе, либо с помощью лекарств, либо местной чистки, которая лишь немного уменьшит площадь и в основном уменьшит воспалительный отек. Единственный способ полностью уменьшить размер карункула — удалить его хирургическим путем. Многие карункулы уретры являются результатом снижения уровня эстрогена у женщин с возрастом, что приводит к росту локализованных карункулов уретры, которые могут привести к гематурии, рецидивирующим инфекциям мочевыводящих путей и ощущению диспареунии, для лечения которых лучшим методом является хирургическое вмешательство.