Иммуногистохимия, выполняемая при валовой патологии щитовидной железы, имеет широкий спектр функций и важна для ранней диагностики рака щитовидной железы, дифференциации подтипов, определения наличия метастазов в лимфатических узлах, степени дифференцировки, а также для выбора препаратов-мишеней для больных позднего возраста. С его помощью можно провести дифференциальную диагностику следующих различных видов рака: 1. дифференциация доброкачественных и злокачественных фолликулярных опухолей. 2. дифференциация классической папиллярной карциномы щитовидной железы и фолликулярных подтипов. 3. Дифференциация солидной и плохо дифференцированной карциномы щитовидной железы. 4. дифференциация мезенхимальной карциномы от саркомы и плоскоклеточной карциномы. Классификация карциномы щитовидной железы определяется морфологией участков опухоли, наблюдаемых патологоанатомом под микроскопом. Однако различные типы опухолей могут иметь очень схожую морфологию под микроскопом, поэтому для постановки диагноза необходимо использовать иммуногистохимию. Иммуногистохимия позволяет патологоанатому узнать больше о белках, содержащихся в клетках.