Основной причиной острого гнойного аппендицита является непроходимость аппендикса. Аппендикс является дистальным закрытым кишечным каналом и чаще всего обтурируется фекальными камнями или остатками пищи, что может привести к нарушению кровоснабжения дистального конца, который сам по себе подвержен росту кишечных бактерий, приводящему к септической инфекции, если инфекция не контролируется своевременно. В тяжелых случаях может произойти перфорация или даже перитонит. Другими причинами являются инфекции кровотока, когда бактерии из других частей тела распространяются через кровь, но такие случаи относительно редки.