При синдроме спинальной эмболии проводится хирургическое вмешательство. В настоящее время операция является единственным методом лечения синдрома спинальной эмболии и стоит около 25 000 долларов. Операция предполагает освобождение от эмболии, устранение причины эмболии, коррекцию сочетанной деформации и максимальное сохранение неврологических функций. Хирургическое лечение позволяет устранить эмболию и компрессию спинного мозга, восстановить локальную микроциркуляцию и способствовать восстановлению функции нервов. Показания к операции следующие: для пациентов, у которых четко диагностирован синдром эмболии спинного мозга, требуется хирургическое вмешательство. Пока общее состояние пациента позволяет, остается спорным вопрос о том, следует ли проводить профилактическую операцию пациентам, у которых обнаружены низкие конусы спинного мозга, но еще нет симптомов. Однако большинство сторонников профилактического хирургического вмешательства, поскольку появление симптомов невозможно предсказать, а после их развития они часто становятся необратимыми.