Успешность искусственного и естественного циклов относительно одинакова, особенно если состояние организма нормальное. Однако в случае аномальной функции яичников успешность естественных циклов относительно выше. Если состояние организма нормальное, например, нормальный менструальный цикл, нормальный уровень гормонов в организме и т.д., то процент успеха трансплантации в искусственном и естественном цикле примерно одинаков. Однако для тех, у кого нарушена функция яичников, трансплантация в естественном цикле невозможна, и необходимо использовать экзогенные гормоны, чтобы скорректировать цикл и синхронизировать эндометрий с гормональным фоном организма для облегчения трансплантации. Использование лекарственных препаратов в искусственном цикле может повлиять на состояние эндометрия, ограничивая рост и развитие эмбриона. В отличие от этого, в естественных циклах обычно лучше функционируют яичники и не требуется вмешательство лекарственных препаратов, что делает среду эндометрия более благоприятной для роста эмбриона. Поэтому процент успешной имплантации в естественном цикле относительно выше. Рекомендуется после консультации врача, в сочетании с собственным состоянием пациента, результатами соответствующих обследований и т.д., сформулировать для себя подходящий метод, что в большей степени может повысить процент успеха.