Тяжесть последствий неокоронавирусной пневмонии зависит в основном от тяжести инфекции. Для пациентов с легкими случаями неокоронавирусной пневмонии прогноз для большинства из них хороший при разумном лечении, и, как правило, значительных последствий не формируется. Однако у пациентов с тяжелыми или критическими заболеваниями последствия могут быть значительными из-за тяжести легочной инфекции и склонности к множественному повреждению органов или отказу. Например, у пациентов с тяжелой пневмонией разрушение легочной ткани очевидно, и даже если болезнь излечена, у некоторых пациентов могут наблюдаться интерстициальные изменения легких, а иногда и фиброз в легких, и их функция легких может быть значительно снижена, а одышка после активности может быть очевидной. У некоторых пациентов также может наблюдаться недоедание и атрофия скелетных мышц, что приводит к снижению толерантности к активности. Иногда дисфункция свертывания крови приводит к образованию тромбоза глубоких вен нижних конечностей, и последствия этого довольно серьезны, а некоторые пациенты даже страдают от тромбоэмболии легочной артерии.