Генетические факторы могут создавать предрасположенность к заболеванию у пациентов с преждевременной эякуляцией. В классическом исследовании Бернхарда Шапиро было показано, что те, у кого большое количество членов семьи страдали от преждевременной эякуляции, были предрасположены к этому состоянию, а Вальдингер и др. подтвердили, что ИЭЛТ первичной преждевременной эякуляции обусловлена генетически: 10 из 14 родственников первой степени родства пациента с первичной ПЭ также страдали ПЭ и имели латентное время эякуляции <1 мин. Поэтому гены также могут быть вовлечены в этиологию ПЭ. Исследование Jern P и др., проведенное среди 3946 близнецов (18-48 лет, средний возраст 29,9 лет), выявило умеренную генетическую предрасположенность (28%) к развитию ПЭ. В дальнейших исследованиях оценивался генотип гена транспортера 5-гидрокситриптамина, который имеет полиморфную ассоциацию с развитием ПЭ и также имеет отношение к использованию SSRIs для лечения ПЭ. Исследования на животных показали, что у мышей, лишенных гена синтазы оксида азота эндотелиального типа, развиваются симптомы ПЭ, а отсутствие гена гемовой оксигеназы G2 приводит к задержке эякуляции и отсутствию эякуляции.