Обыкновенные бородавки можно лечить с помощью физиотерапии, местных топических средств и системных препаратов. Физиотерапия может соскоблить несколько разрозненных бородавок. Более крупные бородавки можно заморозить жидким азотом, температура которого составляет -196°C и вызывает образование кристаллов льда внутри и снаружи пораженных клеток и дегенерацию липопротеинов клеточных мембран, что приводит к гибели пораженных клеток и тканей. Большинство бородавок исчезает после 2-3 процедур. Те, кто устойчив к лечению жидким азотом, можно лечить углекислотным лазером или подкожными инъекциями 0,05%-0,1% блеомицина один раз в неделю. Для фармакологического лечения можно использовать местное применение едкого химического вещества, например, жвачку из огненной шерсти или вороньего гнезда. Лечение подошвенных бородавок сложнее, чем обычных бородавок, поскольку местная кутикула толще и проникновение различных методов лечения плохое, кроме того, частое местное давление ухудшает лечение, так как плохо отслаивает некротическую поверхностную ткань после лечения. Системное лекарство, для некоторых пациентов с большим и распространенным началом заболевания, можно попробовать перорально с ретиноидами, такими как капсулы изотретиноина и капсулы витамина.