Сага о хромосомах человека: бедная Y-хромосома

У человека основными символами, играющими роль в дифференциации особей по полу, являются половые хромосомы: X и Y хромосомы. Люди — диплоидные организмы, и их хромосомы встречаются парами, причем каждая пара хромосом — сестры-близнецы, почти не различающиеся по форме. Но пара половых хромосом X и Y представляет собой некоторое отклонение: согласно схеме нумерации хромосом от самой большой к самой маленькой, X-хромосома должна была бы сидеть на восьмом стуле из 23 пар хромосом, но ее партнер, Y-хромосома, составляет лишь треть ее размера и даже немного меньше самой маленькой, хромосомы 22. Если вы женщина с парой половых хромосом XX, все нормально, и в процессе репликации и воспроизводства женской клетки X-хромосома ведет себя по сути так же, как и остальные 22 пары аутосом: те же две комплементарные пары, рекомбинация и обмен, ты во мне и я в тебе, действующие в общем направлении к устранению различий между ними. Но как только Y-хромосома присоединяется к лагерю генетической информации и половые хромосомы становятся парой XY, все меняется. Y-хромосома слишком коротка, чтобы совершить полный обмен парами и рекомбинациями со своим партнером, X-хромосомой, и вынуждена склоняться вниз и изгибаться по кругу, а затем совершать небольшой обмен парами и рекомбинациями с маленькой Y-хромосомой наверху. Таких обменов недостаточно для поддержания долголетия Y-хромосомы, потому что по законам хромосомного наследования отсутствие рекомбинации и обменов означало бы путь к вымиранию. Так как же Y-хромосома остается стабильной на протяжении долгого времени? Только в 2003 году ученые раскрыли секрет, что Y-хромосома уникальна в своей способности самостоятельно проходить рекомбинацию и взаимообмен. Помимо различий во внешности и поведении, существуют также огромные различия в типах и количестве носимых генов. Например, Y-хромосома несет ген SRY, ключевой ген, инициирующий развитие мужского организма, но не X-хромосома, которая может нести от 2 000 до 3 000 генов, тогда как бедная Y-хромосома может нести только 20-30 генов. Более того, последовательность нуклеотидов на Y-хромосоме представляет собой гору бессмысленного хлама, что затрудняет поиск генетических сокровищ. Подобные характеристики в свое время застопорили проект по секвенированию генома человека. Может ли эта огромная разница в половых хромосомах между женскими и мужскими клетками привести к генетическим нарушениям? Жизнь никогда не бывает сбалансированной, и женские клетки выбирают одну из Х-хромосом, чтобы свернуться в нормальную живую клетку, чтобы сохранить ту же дозу генов на Х-хромосоме, что и у мужчин, подобно тому, как складывают неиспользуемую одежду в шкаф и навешивают на него замок, чтобы запечатать его. Эта сильно свернутая и неактивная Х-хромосома известна как «микросома Барра». Мучительное эволюционное путешествие Y-хромосома не существовала изначально, а была продуктом генетической мутации. Однажды, 300 миллионов лет назад, ген под названием SOX3 на одной из первоначальных половых хромосом мутировал и превратился в ген под названием SRY, который является ключевым геном современной Y-хромосомы, определяющим мужской пол. Ген SRY является ключевым геном современной Y-хромосомы, определяющим мужской пол. Как ученые пришли к выводу, что это событие произошло 300 миллионов лет назад? Большой вклад в это внесла таксономия животных. Пол рептилий не определяется половыми хромосомами; обычно он определяется окружающей средой. Черепахи и крокодилы, например, развиваются как самцы на солнечных берегах водоемов; они развиваются как самки в прохладных, тенистых местах. Немного более продвинутыми, чем рептилии, являются однопроходные млекопитающие, такие как знаменитые утконос и ехидна. Монотремы — самые древние животные с Y-хромосомой, и их пол уже не просто определяется окружающей средой. А поскольку разветвленная эволюция млекопитающих и рептилий произошла 300 миллионов лет назад, ученые сделали вывод, что Y-хромосома появилась именно в этот период. Применив для этого молекулярную биологию и часы молекулярной эволюции, было обнаружено, что гены SOX3 и SRY на X- и Y-хромосомах также имеют историю ветвления в 300 миллионов лет. За мутацией гена SOX3 в ген SRY последовало событие хромосомной инверсии, которое отделило первоначально гомологичный ген SOX3 (в нижней части X-хромосомы) от гена SRY (в верхней части Y-хромосомы). Хромосомные инверсии — более распространенный способ реорганизации внутренних сегментов хромосом, который часто приводит к перестройке положения генов на хромосоме. В отличие от Х-хромосомы, инверсии на Y-хромосоме могут быть исправлены сестрами-близнецами в женских клетках, поэтому эти инвертированные сегменты часто удаляются самой Y-хромосомой, в результате чего со временем, не имея резервной копии для компенсации, бедная Y-хромосома теряет все больше и больше генов и все больше уменьшается, до такой степени, что сегодня ее размер составляет лишь треть от размера Х-хромосомы. Со временем бедная Y-хромосома теряла все больше и больше генов, все больше и больше атрофируясь, до такой степени, что сегодня она составляет лишь треть от размера X-хромосомы. После появления Y-хромосомы у наших предков утконосов, Y-хромосома, которая упорно стремится идти по улице с односторонним движением, подвергалась различным инверсиям и делециям генов, в результате чего гены на Y-хромосоме становились все более отличительными. У человеческих мужчин только два конца Y-хромосомы сохраняют способность рекомбинировать с X-хромосомой, тогда как у женщин две генетически однородные X-хромосомы остаются полностью рекомбинированными во всех частях. Таким образом, после более чем 300 миллионов лет эволюции от примитивных половых хромосом, не имеющих различий, Y-хромосома значительно изменилась по структуре и стала более функционально специализированной в качестве пускового механизма, инициирующего развитие мужского организма. Длительный конфликт Интересно, что Y- и X-хромосомы, возникшие в результате генетических мутаций, — это не пара, созданная на небесах, а скорее пара взаимоисключающих врагов. Корень проблемы между X и Y был впервые заложен 300 миллионов лет назад. В то время мутация в одном гене препятствовала обмену материалом между хромосомами X и Y одинакового размера. Чем больше мутаций было в каждой из них, тем сильнее становились различия, вызванные потерей обмена, как если бы одна постепенно превратилась во влажную южную водную страну, а другая из-за сухости стала обширной северной засушливой территорией. В этом случае ген, который был функционально идентичен на Y-хромосоме в «водной стране», может использоваться для производства твердых, хорошо развитых мужских рогов, содержащих кальций, в то время как на X-хромосоме в «засушливой стране» он может использоваться для производства питательного молока. Таким образом, начинают развиваться половые различия, и для того, чтобы еще больше усилить свои половые признаки, X- и Y-хромосомы набирают больше генов, способствующих акцентированию пола, в конечном итоге формируя генетическую базу для поддержания половых признаков. Гены на Y-хромосоме, которые хороши для самцов, часто вредны для самок; и наоборот, гены на X-хромосоме, которые хороши для самок, всегда пытаются уничтожить мужские признаки. Например, недавно открытый ген на Х-хромосоме, DAX, и ген на Y-хромосоме, SRY, важный ген-переключатель для развития мужских половых органов и производства спермы, являются злейшими соперниками. В нормальных мужских клетках одна копия гена DAX уступает место одной копии гена SRY, и мужские признаки проявляются нормально, но в очень небольшом числе генетически аномальных мужских клеток, имеющих две копии гена DAX на Х-хромосоме, ген DAX атакует ген SRY и легко побеждает его, так что человек выглядит в точности как женщина, хотя его клетки по-прежнему XY. В живых организмах механизм войны приводится в движение сразу же после их создания. Битва между половыми хромосомами иногда просто приводит к смерти друг друга и никогда не будет терпимой. Поскольку у женщин две Х-хромосомы, а у мужчин — одна Х и одна Y, когда две пары хромосом встречаются, три четверти из них — Х и только одна четверть — Y. Таким образом, вероятность того, что Х-хромосома разовьет способность атаковать Y-хромосому, в три раза выше, чем вероятность того, что Y-хромосома разовьет способность атаковать Х. Все гены Y-хромосомы могут быть атакованы бесконечным каскадом Х-генов, и в конце концов Y-хромосома будет атакована. Y-хромосома теряет свою броню и вынуждена «выключить» или удалить большинство генов, ставших мишенью. Именно по этой причине Y-хромосома становится все короче и короче и все более «молчаливой»! Эта затяжная война сделала Y-хромосому настолько уменьшенной и генетически неактивной, что биологи были обеспокоены ее, казалось бы, неизбежной гибелью. Ведущий мировой эксперт по Y-хромосоме Дэвидсон Печче пользовался в тот период большим успехом. Ведущий мировой эксперт по Y-хромосоме Дэвид Пейдж в те мрачные дни написал на своей чашке чая слова «Спасите самца». Однако ученые не ожидали, что Y-хромосома также окажется крепким орешком. Y-хромосома действительно является самой короткой из всех хромосомных «книг» человека, но ее содержимое нелегко понять человеку. На заре проекта по секвенированию генома человека ученые обнаружили, что в средней части Y-хромосомы так много дублирующих генов и инертных генов без физиологической функции, что попытки выделить из этого фрагмента конкретный ген приводили к безумию. Один ученый, работавший над Y-хромосомой, сказал, что анализировать гены на Y-хромосоме — это все равно что войти в комнату, состоящую из зеркал, где везде идентичное и зеркальное изображение, так что вы даже не можете отличить потолок от пола. Только в 2003 году ученые выяснили, что большое количество «теневых» генов на Y-хромосоме на самом деле являются так называемыми палиндромами генетического кода. Например, ABCDEFG и GFEDCBA образуют пару палиндромов, или зеркальных отражений друг друга. Зеркала, которые когда-то разочаровывали ученых, стали воротами к тайнам Y-хромосомы. Эти неразличимые «теневые» гены внесли большой вклад в то, чтобы слабая Y-хромосома не продолжала деградировать в течение миллиардов лет. В то время как все другие хромосомы способны объединяться в пары и рекомбинировать со своими партнерами-близнецами, Y-хромосома может быть восстановлена и сохранена только путем рекомбинации со своим партнером, X-хромосомой, на обоих концах. Как же средний сегмент Y-хромосомы остается стабильным с течением времени? Оказывается, крошечная Y-хромосома может быть изогнута вверх от середины, чтобы обеспечить спаривание и рекомбинацию своего аналога, так что если ген в середине, к сожалению, мутирует, он может быть восстановлен из своего противоположного резервного участка. Вот такая отважная Y-хромосома, которая в отсутствие партнера-близнеца сумела спасти свою жизнь, встав на собственные ноги! Спасение в сотрудничестве Однако эскалация генетического соперничества может быть опасной. Легко понять, как интересы коллектива могут быть поставлены под угрозу, если его члены не будут негласно сотрудничать. Длительная генетическая война неизбежно приведет к снижению выживаемости человеческого организма — жертвы войны. Если бы все гены на Х-хромосоме попытались убить сперматозоид, содержащий Y-хромосому, в человеческом роду не осталось бы больше мужчин, и в конечном итоге гены на Х-хромосоме были бы лишены возможности размножаться. Таким образом, война между X и Y, начавшаяся сотни миллионов лет назад, постепенно перешла в очень разумную и тонкую игру — игру «селективной уборки мусора», открытую Уильямом Амосом и другими. С течением времени, после того как Y-хромосома в основном уступила, Х-хромосома лишь изредка очищала Y-хромосому от генов, идентичных своим собственным, а Х-хромосома никогда не беспокоилась о таких редких генах, как SRY, который контролирует мужественность в нормальных клетках (но иногда Х-хромосома показывала свое истинное лицо и атаковала ген SRY, как в случае с вышеупомянутой Х-хромосомой с двумя копиями). хромосомы с двумя копиями гена DAX). Именно гены, выполняющие «сметающую» функцию, способствуют феминизации вида, и без уравновешивающего эффекта генов SRY, заставляющего их отклоняться в сторону мужественности, человеческий пол в конце концов вышел бы из равновесия. Конечно, возникает вопрос: почему те же самые взаимозаменяемые гены, присутствующие на обоих концах Y-хромосомы, что и на X-хромосоме, не «сбрасываются»? Ответ прост: эти гены — их около пяти — не являются генами, определяющими пол, и их функция заключается только в поддержании основной жизнедеятельности клетки, то есть они являются «генами домашнего хозяйства «, поэтому, казалось бы, нет никакой необходимости в уборке мусора. В некотором смысле, сотни миллионов лет войны между X и Y хромосомами закончились компромиссом, в результате которого Y хромосома превратилась в самую слабую хромосому. Но невероятно, что именно этот жалкий на первый взгляд малыш сегодня является доминирующей силой в человеческом обществе.