Факторы окружающей среды включают биологические, физические, химические и психологические факторы, в том числе инфицирование патогенными вирусами на ранних сроках беременности, включая вирусы простуды и гриппа, а также вирус ветряной оспы. Применение гормонов, сульфаниламидов, некоторых растительных лекарств, противовирусных препаратов и антибиотиков, таких как гентамицин, стрептомицин, тетрациклин и лейкомицин на ранних сроках беременности также может привести к развитию заболевания. Психическая стимуляция на ранних сроках беременности также является предрасполагающим фактором. Генетические факторы также играют определенную роль, и семейная линия является важным ресурсом для изучения генетических факторов врожденной микротии, о которой впервые сообщили в 1978 году как об аутосомно-доминантном заболевании, при котором и мать, и сын страдают односторонней микротией с атрезией. В пяти поколениях семей с этим заболеванием было семь случаев, что свидетельствует об аутосомно-доминантном наследовании с различными фенотипами и низкой частотой эктопий. Большое исследование 171 случая микротии в 96 семьях пришло к выводу, что заболевание является полигенным, а в 2008 году китайские ученые сообщили о кластере случаев в семье, где отец и дочь с правосторонней ушной деформацией были родственниками первой степени родства, предполагая, что генетика является важным фактором. Большинство пациентов с врожденной микротией являются нормальными, но лишь у некоторых пациентов имеются хромосомные аберрации, включая делецию хромосомы 5p, моносомию 6q, делецию хромосомы 8q, трисомию 18, кольцевую хромосому 21, делецию 22q, трисомию 22, 47XXY. мозаицизм и т.д.