Крем Имиквимод может быть использован в клинических условиях для удаления плоских бородавок. Этот крем применяется в 5%-ной рецептуре, в основном в виде мазевого препарата, наносимого непосредственно местно на инфицированный участок плоской бородавки. Его можно наносить примерно три раза в неделю, в основном один раз в день, непосредственно на кожу. Механизм действия заключается в основном в индуцировании альфа-интерферона в инфицированных клетках, таким образом, действуя как прямое антивирусное средство. Однако из-за индивидуальных особенностей некоторые люди не чувствительны к крему Имиквимод, поэтому результаты лечения плоских бородавок у некоторых людей не слишком удовлетворительны. В это время могут быть использованы другие формы лечения, например, лечение иммуномодуляторами, такими как инъекции интерферона.