Латентный период кондиломы обычно протекает без клинических симптомов, кожа и слизистые оболочки в этот период выглядят нормально, и с помощью молекулярно-биологических методов можно определить ВПЧ-позитивность. Инкубационный период инфекционного заболевания — это время от проникновения возбудителя до появления первых клинических симптомов, поэтому инкубационный период кондиломы акуминатум концептуально не имеет клинических симптомов, а кожа и слизистые оболочки в этот период выглядят нормально. Несмотря на отсутствие клинических симптомов и отрицательный результат теста с белым ацетатом, наличие ВПЧ все же может быть обнаружено с помощью молекулярно-биологических методов.