Бактериальный вагиноз не излечивается самостоятельно, и его необходимо лечить с помощью лекарств. Если бактериальный вагиноз не лечить, он может привести к эндометриту, воспалительным заболеваниям органов малого таза и даже к инфицированию культи влагалища после гистерэктомии. Если бактериальный вагиноз присутствует во время беременности, он связан с неблагоприятными исходами беременности, такими как хориоамнионит, преждевременный разрыв мембран, преждевременные роды и эндометрит после родов, поэтому симптоматические беременные пациентки также должны получать медикаментозное лечение. Бактериальный вагиноз также имеет высокий процент рецидивов, и после рецидива важно выбрать другой антианаэробный препарат, отличный от первого лечения, или восстановить и наладить микроэкологический баланс влагалища с помощью Lactobacillus vaginalis.