Новые рекомендации ВОЗ по антиретровирусной терапии были обновлены в ноябре 2009 года и содержат несколько ключевых изменений: рекомендуется раннее лечение, т.е. начало антиретровирусной терапии (АРТ) при CD4 ниже 350. Содействие началу АРТ у беременных женщин с 14-й недели гестации, с возможностью продолжения дозирования во время грудного вскармливания. Руководство также рекомендует AZT и TDF вместо D4T в качестве комбинации препаратов первой линии для лечения. Противовирусные препараты при коинфекции: при коинфекции гепатита В комбинация АРТ должна включать TDF, 3TC или FTC. Руководство было обновлено в издании 2006 года, чтобы привести лечение в районах с ограниченными ресурсами в соответствие со стандартами лечения, которые уже несколько лет применяются в развитых странах.