Нет полной уверенности в том, существует ли связь между подошвенными бородавками и ВПЧ в шейке матки. Некоторые люди, у которых ВПЧ-инфекция развивается в обеих областях, могут иметь определенную степень физической предрасположенности, например, у некоторых пациентов имеется значительная предрасположенность к ВПЧ-инфекции не только в области шейки матки, но и в коже на подошвах ног, отсюда и образование подошвенных бородавок. Однако есть люди, у которых подошвенные бородавки развиваются без прямой причины инфицирования ВПЧ в области шейки матки. В этом отношении эти два заболевания различаются по месту локализации инфекции и подтипу ВПЧ, которым инфицирован больной, и прямой связи между ними нет.